生物信息学博士生陈渊同学喜获硕果
陈渊，植物保护学院2013级生物信息学在读脱产博士生，指导教师袁哲明教授。近期，陈渊每天一到实验室的第一件事就是收Email。7月8日一早，陈渊打开电脑，期待已久的Scientific Reports的接收函赫然蹦了出来；这是他今年发表/录用的第5篇SCI论文。让我们来晒一晒这位“科研小牛”博士在读期间的成绩：
[1] Chen Yuan, Cao Dan, Yuan Zheming*. Discovering Pair-wise Synergies in Microarray Data. Scientific Reports (Accepted，IF 5.23)
[2] Chen Yuan, Zeng Ying, Luo Feng*, Yuan Zheming*. A New Algorithm to Optimize Maximal Information Coefficient. PLoS ONE, 2016, 11(6): e0157567 (IF 3.06)
[3] Chen Yuan, Wang Lifeng, Li Lanzhi, Zhang Hongyan, Yuan Zheming*. Informative gene selection and the direct classification of tumors based on relative simplicity. BMC Bioinformatics, 2016, 17(1): 1 (IF 2.44)
[4] Chen Yuan, Zhou Wei, Wang Haiyan, Yuan Zheming*. Prediction of O-glycosylation sites based on multi-scale composition of amino acids and feature selection. Medical & Biological Engineering & Computing, 2015, 53(6): 535-544 (IF 1.80)
[5] Xiang Yan, Chen Yuan (Co-first author), Tan Siqiao*, Yuan Zheming*. Predicting O-glycosylation Sites by Combining Three Different Types of Features. Progress in Biochemistry and Biophysics, 2016, 43(7): 1~8 (SCI)
[6] Deng Xiaolong, Tan Siqiao, Chen Yuan*, Yuan Zheming*. QSAR Study on the toxicities of alcohols and phenols based on minimal redundancy maximal relevance and distance correlation feature selection methods. Research Journal Biotechnology, 2016, 11(6):81-90 (SCI)
[7] 陈渊, 孙丛苇, 徐西林. 空气中PM2.5问题的研究. 2013年第十届全国研究生数学建模竞赛三等奖
[8] 陈渊, 向妍, 杨黎. 数据的多流形结构分析. 2015年第十二届全国研究生数学建模竞赛三等奖
[9] 陈渊, 向妍, 杨黎. 航班计划的合理编排. 2015年湖南省首届研究生数学建模竞赛三等奖
[10] 袁哲明, 周玮, 张红燕, 王立峰, 代志军, 陈渊. 有监督学习关键问题算法创新与应用. 2014年湖南农业大学自然科学二等奖，2015年度湖南省自然科学三等奖
[11] 陈渊，2015年博士研究生国家奖学金
[12] 陈渊，信息基因分析与筛选（YB2015004），湖南农业大学2015年省级优秀博士论文培育基金
[13] 陈渊，2014年、2015年湖南农业大学研究生科研成就奖一等奖
复杂表型（如肿瘤）/性状（如水稻产量）受多基因与环境共同影响。对两个连续性变量Y与X，常用的Pearson相关系数仅能检测线性关联。2011年，Reshelf等在Science发表了最大信息系数MIC，对任意形式的线性或非线性无噪音一元函数Y=f（X）均有MIC（X；Y）=1，可普适性地测度两变量关联。然而，MIC不能反映两个自变量X1、X2对因变量Y的互作；未考虑互作恰恰是全基因组关联分析中遗传力缺失的重要原因。陈渊同学的主要贡献，在于将MIC从两变量关联推广到考虑配对互作的三变量关联，发展了快速求解MIC（X1，X2；Y）的可信算法，不仅以充分的仿真数据证实了MIC（X1，X2；Y）对任意形式无噪音二元函数Y=f（X1，X2）的普适性，在多个真实组学数据中也检测到了前人未能发现的大量配对互作，并总结了配对互作的3种常见模式（下图）。
陈渊同学是我校2005级生物信息专业首届本科生，大三起即师从袁哲明教授，历时9年，始有小成。
（植物保护学院 张永生）
