一、个人简介

陈渊、男、1987年5月、副教授、硕士生导师、生物信息学、机器学习与生物数据分析。

二、教育背景

2013/09–2016/12 湖南农业大学，生物信息学专业，博士毕业，博士；

2009/09–2012/07 湖南农业大学，生物信息学专业，研究生毕业，硕士；

2005/09–2009/07 湖南农业大学，生物信息学专业，本科毕业，学士。

三、成果介绍

1.主持的主要科研项目：

[1] 国家自然科学基金青年项目：基于普适性关联基因的共表达网络构建(61701177)，主持；

[2] 湖南省自然科学基金青年项目：基于普适性关联基因的共表达网络构建（2018JJ3225），主持

[3] 湖南省教育厅科学研究项目：水稻产量相关的基因-基因互作筛选及共表达网络构建（21B0187），主持

[4] 国家自然科学基金面上项目：基于支持向量机的稻田虫害预测方法研究(31772157)，参与

[5] 国家自然科学基金青年项目：基于变量选择与训练群体优化的植物基因组选择方法研究（31701164 ），参与

[6] 湖南省教育厅科学研究项目：基于多变量关联网络的直接分类及其应用(17A096)，参与

2.主要论文成果：

[1] Yuan Chen, Zhiming Ye, Yanfang Zhang, et al. A deep learning model for accurate diagnosis of infection using antibody repertoires [J]. Journal of Immunology. 2022.4. (IF: 5.4)

[2] Cao D^#, Chen Y^#, Chen J, et al. An improved algorithm for the maximal information coefficient and its application. Royal Society Open Science, 2021, 8(2): 201424. (IF: 2.9)

[3] Ye J, Yang J, Yu J, Tan S, Luo F, Yuan Z, Chen Yuan. A Chi-MIC Based Adaptive Multi-Branch Decision Tree[J]. IEEE Access, 2021, 9: 78962-78972. (IF: 4.1)

[4] Zheming Yuan, Yi Xiao, Zhijun Dai, Jianjun Huang, Zhenhai Zhang, Yuan Chen*. Modelling the effects of Wuhan’s lockdown during COVID-19, China. Bulletin of the World Health Organization, 2020, 98:484-494. (IF: 9.4).

[5] Li Yuting Dai Zhijun, Cao Dan,Luo Feng Luo, Chen Yuan*, Zheming Yuan*.Chi-MIC-share: a new feature selection algorithm for quantitative structure-activity relationship models. RSC Advance, 2020, 10, 19852-19860. (IF: 3.3).

[6] Qifei Wang , Haojian Zhang, Yuqing Liang, Heling Jiang, Siqiao Tan, Feng Luo, Zheming Yuan, Yuan Chen*. A novel method to efficiently highlight nonlinearly expressed genes. Frontiers in Genetics, 2020, 10: 1410. (IF: 4.6)

[7] Zeng Y, Yuan H, Yuan Z*, Chen Yuan*. A high-performance approach for predicting donor splice sites based on short window size and imbalanced large samples[J]. Biology direct, 2019, 14(1): 6. (IF: 4.5)

[8] 袁哲明, 杨晶晶, 陈渊*. 基于最大信息系数与冗余分摊的特征选择方法[J]．计算机工程. 2020.46(8): 101-105.

[9] Chen Yuan, Cao Dan, Jun Gao*, Yuan Zheming*. Discovering Pair-wise Synergies in Microarray Data. Scientific Reports, 2016; 6: 30672 (IF 5.23)

[10] Chen Yuan, Zeng Ying, Luo Feng*, Yuan Zheming*. A New Algorithm to Optimize Maximal Information Coefficient. PLoS ONE, 2016 11(6): e0157567 (IF 3.06)

[11] Chen Yuan, Wang Lifeng, Li Lanzhi, Zhang Hongyan, Yuan Zheming*. Informative gene selection and the direct classification of tumors based on relative simplicity. BMC bioinformatics, 2016, 17(1): 1. (SCI, IF 3.0)

[12] Chen Yuan, Zhou Wei, Wang Haiyan, Yuan Zheming*. Prediction of O-glycosylation sites based on multi-scale composition of amino acids and feature selection. Medical & biological engineering & computing, 2015, 53(6): 535-544. (IF 1.80)

[13] Xing Pengwei^#, Chen Yuan^#(, Gao Jun*, Yuan Zheming*. A fast approach to detect gene-gene synergy. Scientific Reports, 2017, 7(1). (IF 4.26)

[14] Xiang Yan^#, Chen Yuan^# Tan Siqiao, Yuan Zheming*. Predicting O-glycosylation Sites by Combining Three Different Types of Features. Progress in Biochemistry and Biophysics, 2016, 43(7): 1~8 (IF 0.22)

[15] 袁哲明，张弘杨，陈渊*. 基于特征选择和支持向量机的HIV-1型蛋白酶剪切位点预测. 吉林大学学报(工学版), 2017,47(2):639-646. (EI).

[16] Chen Yuan., Yuan Zheming, Zhou Wei, Xiong Xingyao. A novel QSAR model based on geostatistics and support vector regression. Acta Physico-Chimica Sinica [J]. 2009, 25(8), 1587-1592. (SCI, IF 2.26).

3.主要获奖成果:

[1] 2019年湖南省优秀博士学位论文

[2] 2015博士研究生国家奖学金

[3] 空气中PM2.5问题的研究. 2013年第十届全国研究生数学建模竞赛三等奖.

[4] 数据的多流形结构分析. 2015年第十二届全国研究生数学建模竞赛三等奖

[5] 航班计划的合理编排. 2015年湖南省首届研究生数学建模竞赛三等奖

[6] 袁哲明, 周玮, 张红燕, 王立峰, 代志军, 陈渊. 有监督学习关键问题算法创新与应用. 2015年度湖南省自然科学三等奖.